编者按:本文来自腾讯科技,审校 乐学 ,36氪经授权发布。
据外媒报导,世界上最强壮的核算机、IBM超级核算机Summit,现已参加到了对立新冠病毒疫情的战役中来。
IBM超级核算机Summit坐落美国动力部橡树岭国家实验室(ORNL),其首要使命是处理动力、先进资料、人类健康和人工智能等范畴的曾经看似不切实际或不或许完结的使命。
研讨人员在Summit上获得了紧迫核算时刻,用它来以蓝色伟人所说的“史无前例的速度”进行模仿使命。
超级核算机Summit运用IBM POWER9支撑的体系,只需1-2天就能看到成果,而规范核算体系需求几个月的时刻。
经过这项作业,研讨人员挑选出了77种小分子药物化合物。ORNL表明,这些化合物或许值得进一步研讨,以对立导致新冠疫情迸发的SARS-CoV-2冠状病毒。
这台超级核算机模仿了8000多种化合物,以挑选哪些化合物最有或许与冠状病毒的首要“刺突”蛋白结合,使其无法感染宿主细胞。
田纳西大学UT / ORNL CMB博士后研讨员米古拉斯-史密斯(Micholas Smith)在前期结构研讨的基础上,建立了冠状病毒刺突蛋白(也称为S蛋白)的模型。
他运用化学模仿代码进行了分子动力学模仿,剖析了蛋白质中原子和粒子的运动。
史密斯模仿了与冠状病毒刺突蛋白对接的不同化合物,以确认它们中是否有任何一种化合物可以阻挠刺突蛋白粘在人类细胞上。
史密斯说:“运用超级核算机Summit,咱们依据一组规范对这些化合物进行了排名,这些规范与它们与S蛋白刺突结合的或许性有关。”
田纳西大学田纳西大学州长分子生物物理学主席、UT/ORNL分子生物物理中心主任杰里米-史密斯(Jeremy Smith)弥补说:“咱们的成果并不代表咱们已找到了医治新冠病毒的办法。”
“不过,咱们十分期望,咱们的核算成果将为未来的研讨供给信息,并供给一个结构,供实验者用来进一步研讨这些化合物。只要到那时,咱们才干知道其间是否有任何化合物表现出缓解这种病毒所需的特征。”
超级核算机Summit经过其4608个IBM Power Systems AC922服务器节点(每个节点装备两个IBM POWER9 CPU和6个英伟达Tensorcore V100图形处理器)为研讨人员供给了海量数据处理才能,使其峰值功能到达200 petaflops。
超级核算机Summit还被用来协助了解世界的来源,了解阿片类药物危机,并展现人类怎么可以登陆火星。
IBM首席执行官罗睿兰(Ginni Rometty)说:“咱们已要求IBM的技能和职业负责人考虑一切选项,以协助政府和卫生机构监测和办理疫情。”
罗睿兰表明,除了在抗疫中运用超级核算机Summit的核算才能外,IBM的Watson Health健康部分正在与世界各地的卫生安排直接协作,以更好地了解新冠病毒的性质。
她说:“IBM临床开发体系现已免费供给给国家卫生机构,经过供给来自网络设备的数据和剖析来削减临床试验的时刻和本钱。咱们的操作危险洞悉东西现已供给给非营利性安排。”